List of rivers of Estonia
Rivers of Estonia are short and mostly have a small discharge. Only 10 rivers are longer than 100 km. The largest river is the Narva on the Estonian–Russian border, whose average discharge is larger than that of all other Estonian rivers combined.
Longest rivers
List of rivers
List is incomplete.| Name | Length | Basin | Location | Further info | Image |
| Aavoja | 23 | 69.1 | Harju County | ||
| Agali Ditch/River | 1.9 | ||||
| Ahja | 103.4 | ||||
| Alajõgi | 29 | ||||
| Allika | 27.7 | ||||
| Ambla | |||||
| Amme | |||||
| Angerja Creek | 28.3 | ||||
| Anija Creek | |||||
| Antsla | 23 | ||||
| Apna | |||||
| Ärma | |||||
| Aruküla | |||||
| Aruoja | |||||
| Atla | |||||
| Audru | |||||
| Avaste Creek | 12.0 | ||||
| Avijõgi | |||||
| Emajõgi | |||||
| Elbu | |||||
| Elva | |||||
| Enge | |||||
| Ema | |||||
| Esna | 25 | ||||
| Gorodenka | |||||
| Häädemeeste | 18 | ||||
| Haavakivi | |||||
| Halliste | |||||
| Härjapea | |||||
| Harku Creek | |||||
| Helme | |||||
| Hilba | |||||
| Hirmuse | 22 | ||||
| Humalaste | |||||
| Hundikuristiku Creek | |||||
| Hüüru | |||||
| Ilmatsalu | 23 | ||||
| Iskna | |||||
| Jaama River | 16.0 | ||||
| Jaama Creek | 5.8 | ||||
| Jägala | |||||
| Jänijõgi | |||||
| Järveotsa Creek | |||||
| Jõelähtme | |||||
| Jõku | |||||
| Jurga Creek | |||||
| Juudaoja | |||||
| Kääpa | |||||
| Kalita Creek | |||||
| Kalli | |||||
| Kargaja | |||||
| Kärla | 17 | ||||
| Käru | |||||
| Kasari | |||||
| Kata | |||||
| Katku Creek | |||||
| Kavilda | |||||
| Keila | |||||
| Kiruoja | |||||
| Kiudu | 3.0 | ||||
| Kivioja | |||||
| Kloostri | |||||
| Kodila | 26 | ||||
| Kohtla | 29 | ||||
| Kohtra | |||||
| Kolga | 15 | ||||
| Kolga Creek | |||||
| Kondi Creek | |||||
| Koreli Creek | |||||
| Kõpu | |||||
| Koosa | |||||
| Kroodi Creek | 5.2 | 23.8 | Harju County, Maardu | ||
| Kubija Creek | |||||
| Kudruküla Creek | 11 | Ida-Viru County | |||
| Kuivajõgi | |||||
| Kuke | |||||
| Külge Creek | |||||
| Kulgu | |||||
| Kullavere | |||||
| Kunda | |||||
| Kurina | |||||
| Kurna Creek | |||||
| Kuura | |||||
| Laatre | |||||
| Laeva | |||||
| Lahavere Creek | |||||
| Lähkma | |||||
| Laugi | 17.8 | ||||
| Leevi | |||||
| Leisi | |||||
| Leivajõgi | 23 | ||||
| Lemmejõgi | |||||
| Lemmjõgi | |||||
| Liivi | |||||
| Lintsi | |||||
| Lodja Creek | |||||
| Loo | |||||
| Loobu | |||||
| Lõve | |||||
| Luguse | |||||
| Luutsna | |||||
| Maadevahe | 8.0 | ||||
| Mädajõgi | |||||
| Mädara | |||||
| Mäetaguse | 25 | ||||
| Mägara | |||||
| Mähe Creek | |||||
| Maidla | |||||
| Massu | |||||
| Mõra | |||||
| Mudajõgi | 16 | ||||
| Mulkoja | |||||
| Munalaskme Creek | |||||
| Mustajõgi | |||||
| Mustjõgi | |||||
| Mustjõgi | |||||
| Mustjõgi | 38.1 | ||||
| Mustjõgi | |||||
| Mustoja | |||||
| Mustvee | |||||
| Muuga Creek | |||||
| Nahavere Creek | |||||
| Naravere Creek | |||||
| Narva | |||||
| Nasva | |||||
| Navesti | |||||
| Nõmme | 13.3 | ||||
| Nõva | 22.0 | ||||
| Nurtu | |||||
| Nuutri | 11 | ||||
| Õhne | |||||
| Ohukotsu | 12.1 | ||||
| Onga | |||||
| Õngu | 6.8 | ||||
| Orajõgi | |||||
| Paadrema | 30 | ||||
| Paala | |||||
| Pääsküla | |||||
| Pada | |||||
| Pala | |||||
| Pale | |||||
| Palgissaare Creek | |||||
| Paltra | |||||
| Pärlijõgi | |||||
| Pärnu | |||||
| Paunküla Creek | |||||
| Pede | |||||
| Pedeli | |||||
| Pedja | |||||
| Peeda | |||||
| Peetri | |||||
| Penijõgi | 11.0 | ||||
| Piigaste Creek | |||||
| Piilsi | |||||
| Pikknurme | |||||
| Pikva Creek | |||||
| Pirita | |||||
| Piusa | |||||
| Põduste | |||||
| Põltsamaa | |||||
| Porijõgi | |||||
| Poruni | 11 | ||||
| Prandi | |||||
| Preedi | |||||
| Pühajõgi | |||||
| Pühajõgi | |||||
| Punapea | |||||
| Purtse | |||||
| Jõelähtme | |||||
| Raasiku | |||||
| Rannametsa | |||||
| Rannamõisa | |||||
| Rannapungerja | |||||
| Räpu | 20.8 | ||||
| Raudna | |||||
| Raudoja | 12 | location of Raudoja Reservoir | |||
| Reiu | |||||
| Reopalu | |||||
| Retla | |||||
| Riguldi | |||||
| Rõngu | 26 | ||||
| Saarjõgi | |||||
| Sae Creek | |||||
| Saki | |||||
| Saku | |||||
| Salajõgi | |||||
| Salla | |||||
| Salme | 4.4 | ||||
| Sämi | |||||
| Sauga | |||||
| Selja | |||||
| Sigaste Creek | |||||
| Sillaotsa | 15.3 | ||||
| Sitapätsi | |||||
| Sõmeru | 15 | ||||
| Soodla | |||||
| Sõtke | |||||
| Struuga | |||||
| Surju Creek | |||||
| Surjupera Creek | |||||
| Suuremõisa | 16 | ||||
| Taebla | |||||
| Tagajõgi | |||||
| Tänassilma | |||||
| Tarvastu | |||||
| Tatra | |||||
| Teenuse | |||||
| Timmkanal | |||||
| Tirtsi | |||||
| Tiskre Creek | |||||
| Tõdva | |||||
| Tõlla Creek | |||||
| Toolse | |||||
| Topi | |||||
| Tori | |||||
| Tõrvajõgi | |||||
| Tõrvanõmme Creek | |||||
| Tõstamaa | 3.8 | ||||
| Treppoja | |||||
| Tuhala | |||||
| Tuudi | 27.8 | ||||
| Ulila | |||||
| Umbusi | |||||
| Unguma | 10.1 | ||||
| Ura | |||||
| Uueveski Creek | 5.2 | 23.8 | Viljandi County | ||
| Uruste Creek | |||||
| Vääna | |||||
| Vaemla | |||||
| Vahejõgi | 1.3 | ||||
| Vaidava | |||||
| Väike Emajõgi | |||||
| Vainupea | |||||
| Valgejõgi | |||||
| Valuoja | 9.3 | 13.6 | Viljandi County | ||
| Vanajõgi | 8.0 | ||||
| Vändra | |||||
| Vara Creek | |||||
| Vardi | |||||
| Vardja | |||||
| Varsaallika Creek | |||||
| Värska Creek | |||||
| Vasalemma | |||||
| Vaskjõgi | |||||
| Veelikse Creek | |||||
| Velise | |||||
| Verioja | |||||
| Veskijõgi | 11.6 | ||||
| Vigala | |||||
| Vihterpalu | |||||
| Visela | |||||
| Visula | |||||
| Vodja | |||||
| Võhandu | |||||
| Võhkse | |||||
| Võhu | |||||
| Võlupe | |||||
| Vorsti | |||||
| Võsu |